Specjaliści gastroenterolodzy do roku 2011 w trakcie egzaminu specjalizacyjnego zdawali egzamin z praktycznej umiejętności wykonywania gastroskopii, kolonoskopii i USG jamy brzusznej, dzięki czemu nabywali uprawnienia do wykonywania tych badań.
Poza tym istnieje jeszcze system certyfikatów umiejętności, które mogą nabywać lekarze innych specjalności.